Estas equivocado, en una placa base actual hay PCI-E o sea PCI-Express, y PCI 2.0 normal, los cuales no son compatibles entre si.
El PCI-E (PCI-E 16X) sale de la necesidad de aumentar el ancho de banda de las tarjetas graficas, que aumenta 4 veces el ancho de banda del AGP 8X.
Aparte hay tb PCI-E 2X (para algunas controladoras raid o SCSI) y PCI-E 4X (para por ejemplo las nuevas graficas de fisica)
La situacion de estos slots varia segun el fabicante de la placa base, y del fabricante del NB (NorthBridge) de dicha placa, que a la postre determinara el sistema grafico que montara el sistema. Aun asi suenen ir en la parte de abajo de la caja las tarjetas PCI 2.0 estandar (PCI normal) ,mientras que las PCI-E 2X van arriba de estas, y mas arriba las PCI-E 16X, para sistemas Graficos Duales, con un posible PCI-E 4X en medio de ambas.
Espero haberte ayudado a disipar tus dudas.
Un saludo.
