1.-Pásale un CHKDSK al disco: botón Inicio-->Ejecutar-->CMD
Código:
chkdsk C: /r
2.-Si no se solucionara, deshabilita el "Restaurar el sistema" (OJO: se borran todos los puntos de restauración existentes), vacía los archivos temporales de Internet y de Windows y la Papelera (con el "Liberador de espacio en disco"), y revisa el tamaño del archivo de paginación
3.-Si aún así no cambia el espacio en disco, baja el SequoiaView y ejecútalo para que te muestra gráficamente el espacio en disco...